SURVIVOR是一套用于模拟/评估SV、合并和比较样本内及样本间SV的工具集,其还可对SV进行重新格式化及进行统计总结,其他详细信息也可参考工具的wiki。安装gitclonehttps://git

不同的结构变异(structuralvariation,SV)鉴定工具鉴定出的VCF结果文件格式不尽相同,但也不是完全没有规律可循,主要的格式就有两种,分别是:BNDnotation:BND表示法,即

本文的部分内容来源于“Comprehensiveevaluationandcharacterisationofshortreadgeneral-purposestructuralvariantcall

散点图常用于展示两个变量之间的关系。下面将首先展示如何在R中绘制散点图;使用ggpubr包中的函数来添加相关系数和显著性水平;还将介绍如何进行分组着色以及如何在每个组周围添加椭圆。此外,还将展示如何绘

下面将介绍下如何轻松绘制带有误差线的均值或中位数(如下图)。加载数据library(ggpubr)#ToothGrowth数据集data("ToothGrowth")head(To

平时在阅读文献时经常会看到一些加标签的图,比如下面这张:那如何来方便地绘制呢?下面就介绍下如何使用R包ggpubr来绘制带有文本标签的直方图和密度图。下面将使用ggpubr包中的gene_citati

要想在同一页面上排列多个ggplot2图形,基本的R函数par()和layout()是无效的。解决方案之一是使用 gridExtra包中的一些函数来排版多个图形:grid.arrange(),arra

本文将介绍如何使用ggpubr包中的ggpar()函数简单轻松地更改ggplot2绘图参数。ggpar()可以更改的图形参数包括:主标题、轴标签和图例标题图例位置和外观颜色坐标轴范围坐标轴的转换:lo

ggpubr包中的facet()函数可以绘制一个或两个变量分组数据集的分面图形。下面将介绍如何按一个或多个变量拆分数据,以及如何可视化数据的子集。基本图形绘制加载数据library(ggpubr)df

ggplot2(HadleyWickham开发)是目前R语言数据可视化的主流。与R的基础绘图系统相比,基于grid绘图系统的ggplot2已经在语法理解性上已经进步很多,但是通过ggplot2绘制用于